пропозиції роботи
Zuzanna (. CEMED
Temat: Warsztaty "Real-time PCR w diagnostyce medycznej"
Warsztaty "Real-time PCR w diagnostyce medycznej"15-16 czerwca 2009, Poznań, Uniwersytet Medyczny w Poznaniu
Warsztaty poprowadzą: dr Marcin Hołysz z Katedry i Zakładu Biochemii i Biologii Molekularnej, Uniwersytetu Medyczny w Poznaniu oraz dr Tomasz Dzieciątkowski z Centralnego Szpitala Klinicznego Warszawskiego Uniwersytetu Medycznego.
Podczas warsztatów uczestnicy nabędą umiejętności: doboru i zakupu sprzętu do prowadzenia reakcji Real-time PCR, izolacji kwasów nukleinowych z prób klinicznych na potrzeby diagnostyki opartej o Real-time PCR, przeprowadzania reakcji i rozwiązywania problemów technicznych związanych z obsługą sprzętu, analizy wyników i ich przygotowanie na potrzeby odbiorców (lekarzy,
pacjentów etc.), rozpoznania kontekstu klinicznego wykonywanych analiz i umiejętność doradzenia w zakresie doboru materiału do badań oraz oceny jakościowej i ilościowej wyników.
Więcej informacji i rejestracja: http://www.cemed.pl/spotkania/2009/rt_pcr/index.php
Program:
DZIEŃ 1 - 15 czerwca 2009
10:20 Rozpoczęcie warsztatów
10:30 Wykład: Podstawy techniki Real-Time PCR
- podstawowe różnice między klasycznym PCR, Real-Time PCR a ilościowym PCR (qPCR)
- terminologia stosowana do opisu technik PCR w czasie rzeczywistym
- rodzaje sond i metod detekcji kwasów nukleinowych stosowanych w urządzeniach Real-Time PCR (SYBR Green, TaqMan, Molecular Beacons, Scorpions etc.)
- przegląd głównych grup zastosowań (proste pomiary ilości DNA, mierzenie poziomu ekspresji genów, wykrywanie mutacji i polimorfizmów etc.)
- ograniczenia metody Real-Time PCR
dr Marcin Hołysz
11:15 Przedstawienie planu zajęć praktycznych (omówienie ćwiczeń)
11:30 Zajęcia praktyczne: Przygotowanie matrycy do reakcji PCR, czyli izolacja DNA z próbek klinicznych
13:15 Przerwa na obiad
14:00 Zajęcia praktyczne: Zapoznanie się z urządzeniem do prowadzenia reakcji PCR z możliwością pomiaru w czasie rzeczywistym: zasada działania, aplikacje, software
14:30 Przygotowanie i przeprowadzenie reakcji: Ilościowe badanie obecności wirusa CMV z użyciem fluorochromu SYBR Green
15:45 Przerwa na kawę
16:15 Wykład: Zastosowania techniki Real-Time PCR w diagnostyce medycznej:
- przekazywanie próbek od pacjenta do laboratorium (specyfika przechowywania i transportu materiału przeznaczonego do izolacji DNA) - próbki śliny, krwi, zastosowanie kart typu FTA etc.
- zakres czułości (uwagi praktyczne w kontekście badań diagnostycznych)
- przegląd testów opartych o Real-Time PCR uwzględnionych w protokołach leczenia przyjętych w Polsce
dr Tomasz Dzieciątkowski
17:00 Analiza, omówienie wyników oraz sformułowanie diagnozy z reakcji: Ilościowe badanie obecności wirusa CMV z użyciem fluorochromu SYBR Green
17:30 Zakończenie dnia
DZIEŃ 2 - 16 czerwca 2009
9:00 Rozpoczęcie warsztatów
9:10 Przygotowanie i przeprowadzenie reakcji: Ilościowe badanie obecności wirusa EBV z wykorzystaniem sond LightCycler oraz analizy krzywych topnienia produktów reakcji PCR
10:10 cz. I Wykład: Praktyczne rady dotyczące zakupu i eksploatacji urządzeń Real-Time PCR
- funkcje podstawowe
- funkcje zaawansowane
- certyfikaty
dr Marcin Hołysz
10:40 cz. II Wykład: Praktyczne rady dotyczące zakupu i eksploatacji urządzeń Real-Time PCR
- koszty eksploatacji
- odczynniki i gotowe zestawy
- startery, czy warto projektować własne?
- kontrola jakości
dr Tomasz Dzieciątkowski
11:10 Analiza, omówienie wyników oraz sformułowanie diagnozy z reakcji: Ilościowe badanie obecności wirusa EBV z wykorzystaniem sond LightCycler oraz analizy krzywych topnienia produktów reakcji PCR
11:40 Przerwa na kawę
12:10 Przygotowanie i przeprowadzenie reakcji: Zastosowanie multiplex qPCR do wykrywania obecności mutacji w genie K-RAS (diagnostyka molekularna w terapii celowanej raka jelita grubego)
13:10 Wykład i dyskusja: Rozwiązywanie problemów interpretacji i opracowania wyników na potrzeby lekarzy klinicystów oraz badań epidemiologicznych
dr Tomasz Dzieciątkowski
13:50 Przerwa na obiad
14:30 Analiza, omówienie wyników oraz sformułowanie diagnozy z reakcji: Zastosowanie multiplex qPCR do wykrywania obecności mutacji w genie K-RAS (diagnostyka molekularna w terapii celowanej raka jelita grubego)
15:00 Sesja "TROUBLESHOOTING" czyli wspólne rozwiązywanie problemów technicznych
- omówienie typowych problemów
- omówienie przypadków przedstawionych przez uczestników
spotkania
dr Tomasz Dzieciątkowski i dr Marcin Hołysz
15:45 Zakończenie dnia
